。仪器简单易操作，但是使用不规范也会导致一些故障问题，包括电机故障、搅拌子问题、速度控制问题、电源问题或噪音问题等。
检查容器是否在平台的正中心，搅拌子是否在容器的正中心并紧贴底部，在运行前，一定要确保搅拌子处在中心位置，这样搅拌子才能正常的旋转并在容器中形成稳定的涡流。
搅拌子与平台下的旋转磁铁解耦的一个原因是在使用的过程中速度提高得太快，这就可能会引起搅拌子失去与磁铁的稳定吸引，并远离其在容器中的中心位置而停转，甚至是冲撞容器壁。处理此问题的最佳方法是慢慢稳定提高搅拌子的速度。这不但可以防止搅拌子旋转失控，还可以大大降低样品飞溅的可能。
搅拌子失衡除了是搅拌子不合适的原因，还可能是所选的搅拌容器不适合。容器的形状、大小和厚度等因素有几率会使搅拌子耦合不良或者与容器摩擦过大等，造成搅拌子失衡。平底容器更适合常规圆柱形搅拌子，拱形底部容器则不适合使用。
解决此问题的方法是使用合适的搅拌子。不同的搅拌子设计用在所有用途的搅拌工作，若使用不合适的搅拌子有几率会使诸如解耦和混合不充分等问题，选择正真适合的搅拌子特别的重要。例如，三角形搅拌子会产生大量湍流，并能通过充当刮刀来帮助固体溶解或防止沉淀；椭圆形、球形搅拌子通常用于试管和小瓶中的小体积样品；A型橄榄型搅拌子在底部弯曲或不平坦的容器中可保持理想的位置，可用于圆底容器；带环的B型圆柱搅拌子用于平底容器，能够大大减少与容器的摩擦等。
选择搅拌子的同时，不仅形状很重要，而且尺寸大小也很重要。搅拌子的长度应与驱动磁铁大致相同才可能正真的保证最佳的搅拌效果。
磁力搅拌器的功能受到其内部驱动磁体的尺寸和强度的限制。如果磁铁又小又弱，它可能难以混合大体积或粘性物质，可能会引起搅拌子卡住或混合不充分。搅拌的体积及强度要和搅拌器规格匹配。
磁力搅拌器可能不是满足所有混合需求的最佳选择。如果您已经评估了上述因素，但仍然遇上问题，那就能考虑使用顶置式搅拌器进行搅拌。顶置式搅拌器的扭矩比较大，可以搅拌混合物质的体积和粘度都比较大，可以轻松搅动磁力搅拌器搅不动的材料。
点成生物可提供多款高性能的搅拌器，包括大容量磁力搅拌器、高速磁力搅拌器、加热磁力搅拌器、轻薄型磁力搅拌器、多点位磁力搅拌器、顶置式搅拌器。
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